MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 9401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010999	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010999	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010999	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010999	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010999	CTATTA	2	12	1543	1554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010999	TATAT	2	10	1567	1576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010999	AT	4	8	1573	1580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010999	AGG	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010999	CAA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010999	A	6	6	2773	2778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010999	AG	3	6	2785	2790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010999	TGA	2	6	2791	2796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010999	T	6	6	2810	2815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010999	ATA	3	9	2863	2871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010999	ACGT	2	8	2963	2970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010999	GAA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010999	TAG	3	9	3009	3017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010999	TCC	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010999	AT	3	6	3035	3040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010999	ATA	3	9	3079	3087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010999	AT	3	6	3096	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010999	ATA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010999	AAAAGT	2	12	3350	3361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010999	AGT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010999	TAAT	2	8	3515	3522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010999	GAC	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010999	TGA	2	6	4961	4966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010999	AGG	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010999	GAG	2	6	7053	7058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010999	TAA	2	6	9695	9700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010999	TTTG	2	8	9776	9783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010999	TCC	2	6	10508	10513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010999	GCAA	2	8	10592	10599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010999	AGA	2	6	10606	10611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010999	TGC	2	6	10646	10651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010999	AGG	2	6	10670	10675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010999	CGC	2	6	11126	11131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010999	AGG	2	6	11228	11233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010999	T	6	6	11547	11552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010999	GGA	2	6	12241	12246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010999	A	7	7	12499	12505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010999	T	7	7	12537	12543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010999	ATT	2	6	12544	12549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010999	A	6	6	12554	12559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010999	AGA	2	6	12614	12619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010999	ATTA	2	8	12660	12667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010999	GAA	2	6	12683	12688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010999	TAG	2	6	12747	12752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010999	TA	3	6	12821	12826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010999	TAA	2	6	12828	12833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010999	TGT	2	6	12843	12848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010999	GGA	2	6	12876	12881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010999	AAT	2	6	12900	12905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010999	AAG	3	9	12909	12917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010999	GTCGA	2	10	14529	14538	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010999	ATA	2	6	14608	14613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010999	TA	3	6	14617	14622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010999	CAA	2	6	14721	14726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010999	GGT	2	6	14753	14758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010999	AAT	2	6	15068	15073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010999	T	6	6	15132	15137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010999	AACG	2	8	15204	15211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010999	AGC	2	6	15239	15244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010999	TA	3	6	15286	15291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010999	ATT	2	6	15346	15351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010999	T	7	7	18129	18135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010999	GAA	2	6	18858	18863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010999	AAGC	2	8	18874	18881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010999	A	6	6	18909	18914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010999	TC	3	6	18921	18926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010999	A	6	6	18935	18940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010999	CAT	2	6	18947	18952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010999	TTG	2	6	18953	18958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010999	TAA	2	6	19019	19024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010999	TG	3	6	19025	19030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010999	AAC	2	6	19081	19086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010999	ATT	2	6	19140	19145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010999	TAAT	2	8	19641	19648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010999	AT	3	6	19647	19652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010999	AC	3	6	19691	19696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010999	CAA	2	6	20125	20130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010999	AGC	2	6	20205	20210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010999	A	8	8	20228	20235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010999	CGTT	2	8	20295	20302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010999	A	6	6	20304	20309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010999	A	6	6	21198	21203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010999	TTC	2	6	21237	21242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010999	T	6	6	21462	21467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010999	CCT	2	6	21685	21690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_010999	AGCT	2	8	21734	21741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010999	TA	3	6	21788	21793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010999	GAT	2	6	21917	21922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010999	CAG	3	9	21923	21931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010999	CGAG	2	8	21944	21951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010999	CCT	2	6	22040	22045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010999	A	7	7	22054	22060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010999	CTT	2	6	22097	22102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010999	GGGT	2	8	22161	22168	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010999	TGA	2	6	23556	23561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010999	A	6	6	23572	23577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010999	GAC	2	6	23588	23593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010999	CCT	2	6	26908	26913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_010999	TG	3	6	26932	26937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010999	GTTTT	2	10	27132	27141	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010999	ATG	2	6	27162	27167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010999	GGA	2	6	27171	27176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010999	ATA	2	6	27758	27763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010999	GGTT	2	8	28928	28935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010999	T	6	6	28947	28952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010999	CATA	2	8	28974	28981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010999	AGA	2	6	28988	28993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010999	T	6	6	29037	29042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010999	GTT	2	6	29053	29058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010999	AGTG	2	8	29120	29127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010999	TTG	2	6	29156	29161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010999	AGC	2	6	29299	29304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010999	GT	3	6	29318	29323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010999	TTG	2	6	29440	29445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010999	TCT	2	6	29456	29461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010999	A	7	7	29504	29510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010999	A	6	6	29544	29549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010999	AGA	2	6	29553	29558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010999	T	6	6	29581	29586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010999	CCT	2	6	30258	30263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010999	TAT	2	6	32435	32440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010999	TG	3	6	32444	32449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010999	CTC	2	6	33381	33386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010999	AC	3	6	33463	33468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010999	GAA	2	6	33545	33550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010999	AAT	2	6	34169	34174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010999	TTCTT	2	10	34195	34204	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010999	ATGA	2	8	34209	34216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010999	AGC	2	6	35217	35222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010999	CAA	2	6	35911	35916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010999	AAGC	2	8	35975	35982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010999	CA	3	6	36090	36095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010999	AGCA	2	8	37481	37488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010999	ATTT	2	8	37529	37536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010999	TCA	2	6	37555	37560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010999	TA	3	6	37607	37612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010999	AG	3	6	38054	38059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010999	AAAC	2	8	38566	38573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010999	CT	3	6	38643	38648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010999	CAT	2	6	38661	38666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010999	AAG	2	6	40193	40198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010999	A	7	7	40208	40214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010999	TCA	2	6	40242	40247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010999	AGAA	2	8	40299	40306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010999	AGC	2	6	41020	41025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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